El Marco Estatutario de la Red Mundial de Reservas de Biosfera especifica en su Artículo 4 que toda Reserva de Biosfera deberá tomar medidas para dotarse de:
1. Un mecanismos de gestión de la utilización de los recursos y de las actividades humanas.
2. Una política o un plan de gestión de la zona en su calidad de reserva de biosfera.
3. Una autoridad o un dispositivo institucional encargado de aplicar esa política o ese plan.
En virtud de los nuevos requerimientos que afectan a las funciones de las reservas de biosfera y de los marcos reglamentarios y jurídicos que afectan actualmente a su forma de operar, la Reserva de Biosfera de El Hierro se dota del siguiente sistema de gestión:
Consejo Rector, en él se representan las distintas competencias y administraciones que afectan a la gestión del territorio y los recursos de la Reserva (locales, insulares, regionales y estatales), con la finalidad de coordinar la correcta promoción de iniciativas y orientar los recursos y capacidades hacia el cumplimiento de los objetivos y funciones de la RB.
Consejo Científico, responsable de asesorar a los órganos ejecutivos de la Reserva de Biosfera y de apoyar un sistema de seguimiento y evaluación permanente de las acciones e iniciativas en la Reserva de Biosfera de El Hierro dentro de las líneas marcadas por el Plan de Acción. Se trata de un órgano consultivo, de asesoramiento y soporte para las iniciativas de capacitación y conocimiento. Una de las características de las Reservas de Biosfera es la necesidad de fundamentar las actuaciones y estrategias sobre bases científicas, tanto en materia de conservación del patrimonio natural y cultural como de iniciativas para el desarrollo sostenible.
Consejo de Participación, foro de representación de los distintos colectivos de la sociedad civil en la Reserva de Biosfera. Es la representación más amplia de la sociedad; asociaciones agropecuarias, del sector pesquero, turísticas, industriales y de servicios, asociaciones conservacionistas y/o ecologistas, culturales y vecinales. Constituye la ventana abierta al sistema participativo preceptivo a desarrollar en la Reserva de Biosfera de El Hierro.